三、血液肿瘤全融合谱——转录组(RNAseq)分析
全融合谱,是指通过转录组测序(RNAseq),对全部有表达的基因的mRNA进行测序分析,得到全部融合基因的序列信息。
传统的融合基因检测方法(RQ-PCR、FISH)存在严重局限,只能检测已知伙伴基因的已知断点的融合基因,漏检率非常高
即便是有限的三四十对融合基因,传统方法也只能检测有已知的确定的断点的融合,如果断点在所设计的探针或引物检测范围之外则无法检测到。
但转录组测序(RNAseq)是对所有基因的mNRA序列进行不加选择的测序,理论上可以检测到全部融合转录本。
- 全融合谱揭示融合基因转录本
- 全融合谱发现新的融合基因